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Annick LESNE PDF Imprimer Envoyer
Écrit par lptmc   
Mercredi, 13 Mai 2009 15:31







LESNE Annick - Cr CNRS
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PUBLICATIONS


BOOKS

Codirection de la collection Échelles (Belin) avec Michel Laguës
présentation des ouvrages de la collection

Responsable éditoriale aux Éditions Cassini
site des Editions Cassini

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A. Lesne (éd.) Cell Population Dynamics in Cancer Progression, special 
issue of Mathematical Population Studies, volume 17, issue 3 (2010).
link to the issue on the publisher site
editorial of the special issue 
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* P. Castiglione, M. Falcioni,  A. Lesne, A. Vulpiani.
Chaos and coarse-graining in statistical mechanics,
Cambridge University Press (2008).
book presentation

French version:  Chaos et  approches multiéchelles en physique statistique, Belin (2008).
présentation du livre
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* J.F. Dars A. Lesne, A. Papillault (éditeurs).
Les Déchiffreurs
Voyage en mathématiques

Belin (2008).
présentation du livre

English version: The unravelers, 
A.K. Peters (2008).
book presentation

Japanese version: Springer Japan (2008).

Chinese version (2010)

Corean version in preparation (Kungree).

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*  A. Lesne, P. Bourgine (éditeurs).
Morphogenèse.
L'origine des formes.

Collection "Échelles",  Belin, Paris (2006).
présentation du livre

English version "Morphogenesis", Springer (2011)
a sample can be read online here

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* E. Charpentier, E. Ghys, A. Lesne (éditeurs).
L'héritage scientifique d'Henri Poincaré
Collection "Échelles",  Belin, Paris (2006).
présentation du livre

English version: The scientific  legacy of  Henri Poincaré, AMS Publications (2010)
book presentation

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* E. Charpentier, A. Lesne, N. Nikolski (éditeurs).
L'héritage de A.N. Kolmogorov en mathématiques
Collection "Échelles",  Belin, Paris (2004).
ISBN 2-7011-3669-5
présentation du livre

English version:  The legacy of  A.N. Kolmogorov in  mathematics, Springer (2007).
a sample  can be read online here
book presentation (hardcover)
book presentation (softcover)
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* M. Laguës, A. Lesne.
Invariances  d'échelle
(des changements d'état à la turbulence)
Collection "Échelles",  Belin, Paris (2003).
ISBN 2-7011-3175-8
Second edition: 2008.
présentation du livre

English version "Scale Invariance"  (Springer 2011)
book presentation
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* Translation:
La construction du vivant. Gènes, embryons et évolution.
J. Maynard Smith
Editions Cassini, Paris (2001)
ISBN --84225-041-9
couverture
présentation
site des Editions Cassini
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* D. Stauffer, H.E. Stanley, A. Lesne.
Cours de Physique
(de Newton à Mandelbrot)
Springer, Paris (1999).
ISBN 2-287-59674-7
couverture
présentation
table des matières
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*
A. Lesne
Méthodes de Renormalisation
Eyrolles, Paris (1995).
ISBN 2-212-05830-6
couverture
présentation
table des matières

translation:
Renormalization Methods
Wiley, Chichester (1998).
ISBN 0-471-96689-4
cover
backcover
contents
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Mémoire d'habilitation 
(30 juin 2003)

     Approches multi-échelles en physique et biologie

texte principal
annexes

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ARTICLES 

* A. Lesne. 
Regularization, renormalization, and renormalization groups : relationships and epistemological aspects
pp. 121-154 in 
"Vision of Oneness"edited by  I. Licata and A.J. Sakaji, Aracne Editrice, Roma (2011)

* C. Bécavin, J.M. Victor, A. Lesne, The condensed chromatin fiber : an allosteric chemo-mechanical machine for signal transduction and genome processing,  Physical Biology.

 
* M.T. Hütt, M.K. Jain, C.C. Hilgetag, A. Lesne. Stochastic resonance in discrete excitable dynamics on graphs, Chaos, Solitons and Fractals
 
* G. Debret, C. Jung, J.P. Hugot, L. Pascoe, J.M. Victor, A. Lesne.
Genetic susceptibility to a complex disease: The key role of functional redundancy,
History and Philosophy of Life Sciences (2011).
preprint

* J.L. Blanc, L. Pezard, A. Lesne.
 Mutual information rate of a pair of symbolic sequences,   
Physical Review E 84, 036214 (2011) 

* A. Lesne.
Statistical entropy: at the crossroads between probability,  information theory, dynamical systems and statistical physics,
Mathematical Structures in Computer Science (2011)  


* C. Bécavin, N. Tchitchek,   C. Mintsa-Eya,  A. Lesne, A. Benecke,
Improving the efficiency of Multidimensional Scaling in the analysis of high-dimensional data using Singular Value Decomposition, 
.


* A. Lesne and J.M. Victor,
Biologie des systèmes: intégrer les mécanismes moléculaires pour soigner la personne
in "La santé par l'innovation", ouvrage  collectif coordonné par Philippe Cramer, à paraître aux éditions Odile Jacob (2011)
preprint


* C. Deygout, A. Lesne, F. Campillo, A. Rapaport,
 A multiscale approach for biofilm modelling: application for growth in a plug flow reactor, 
http://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00604377/fr

* P. Yordanov, S.Tyanova, M.T. Hütt. and A. Lesne. 
Asymmetric transitions and time-scale separation in interlinked positive feedback loops, 


 
 
* C. Gruber, A. Lesne.
Adiabatic piston
 Modern Encyclopedia of Mathematical Physics,
edited by  D. Sternheimer and I. Arefeva, in print,  Springer (2011)

* M. Malo, G. Hutzler, F. Delaplace, G. Barlovatz-Meimon, A. Lesne. 
When a collective outcome triggers a rare individual event : a mode of metastatic process in a cell population 

Mathematical Population Studies, vol 17, pp. 136-165 (2010) 
Preprint disponible sous HAL
Erwin Schrödinger Institute preprint 2286

 

* P. Faure, A. Lesne. 
Recurrence plots for symbolic sequences
 International Journal of Bifurcation and Chaos, vol. 20, pp. 1731-1749 (2010)


*C. Bécavin, M. Barbi, J.M. Victor, A. Lesne

Transcription within condensed chromatin : Steric hindrance facilitates elongation
Biophysical Journal, vol. 98, pp. 824-833 (2010)

 
 
* M.T. Hütt. and A. Lesne. 
Interplay between topology and dynamics in  excitation patterns on hierarchical graphs 
 
 
* A. Lesne. 
Biologie des systèmes : l’organisation multiéchelle des systèmes 
vivants 
 
* A. Lesne, J.L. Blanc, L. Pezard.
Entropy estimation of very short symbolic 
sequences
* A. Lesne. 
Complexité du vivant, sélection naturelle et évolution
Natures, Sciences, Sociétés, vol. 16, pp. 150-153 (2008)
Commentaire: A. Lesne. 
À propos du texte “Complexité du vivant, sélection naturelle et
 évolution” 
Natures, Sciences, Sociétés,  vol. 17, pp. 55-56 (2009).


* A. Lesne, A. Benecke.
Feature context-dependency and complexity reduc
tion in probability landscapes for integrative genomics 
 
 
* J.L. Blanc, N. Schmidt, L. Bonnier, L. Pezard, A. Lesne. 
Quantifying
 neural correlations using Lempel-Ziv complexity
pp.40-43  in Proceedings  of the Second french conference on Computational Neuroscience (Neurocomp’08), 
edited by L.U. Perrinet et E. Daucé (ISBN (978-2-9532965-0-1) (2008)


 
* N. Maubourguet, A. Lesne, J.P. Changeux, U. Maskos, P. Faure. 
Beha
vioral sequence analysis reveals a novel role for β 2 nicotinic receptors in exploration
 
* A. Lesne, A. Benecke.
Probability landscapes for integrative genomics
 
 
* A. Lesne. 
Robustness : confronting lessons from physics and biology 
 


* K. Doba, J.L. Nandrino, A. Lesne, C. Humez, L. Pezard.
Organization of the narrative components in the autobiographical speech of anorexic 
patients : A statistical and non-linear dynamical analysis 
 
 
 

* A. Lesne
Déterminisme et aléatoire dans les systèmes complexes : un faux débat ?
Déterminismes et Complexités : du Physique à l’Éthique, 
édité par  
D. Chavalarias, C. Cohen-Boulakia et P. Bourgine. Éditions La Découverte, Paris (2008)
 
 
* L. Pezard, A. Lesne.
Cellular automata approach of transmembrane ionic currents
 
 

* H. Krivine, A. Lesne, J. Treiner.
Discrete-time and continuous-time modeling: some bridges and gaps

"Mathematical Structures in Computer Sciences", vol. 17, pp. 261-276 (2007)        link MSCS


* 
A. Lesne.
Discrete vs continuous controversy in physics
  "Mathematical Structures in Computer Sciences", vol. 17, pp. 185-223 (2007)      link MSCS


* A. Lesne.
Complex networks: from graph theory to biology
 Letters in Mathematical Physics, vol. 78, pp. 235-262 (2007) 



*
D. Pesme, R. L. Berger, E. A. Williams, A. Bourdier, A. Lesne. 
statistical description of parametric instabilities with an incoherent pump 
 
 
* K. Doba, L. Pezard, A. Lesne, V. Christophe, J.L. Nandrino. 
Dynamics of  emotional expression in autobiographical speech of patients with anorexia  nervosa



* A.R. Carvunis, M. Latapy, A. Lesne, C. Magnien, L. Pezard.
Dynamics of three-state excitable units on random vs power-law networks
Physica A, vol. 367, 595--612 (2006)


* J. Mozziconacci, C. Lavelle, M. Barbi, A. Lesne, J.M. Victor.
A physical model for the condensation and decondensation of eukaryotic chromosomes
FEBS Letters vol. 580, 368-372 (2006)


* C. Gruber, A. Lesne.
Adiabatic piston
article MS412 in Encyclopedia of Mathematical Physics (vol. 1, pp. 160--173)
 J.P. Françoise, G. Naber, T.S. Tsun (eds.) Elsevier (2006)


* A. Lesne.
Multi-scale approaches
article MS101  in Encyclopedia  of Mathematical Physics (vol. 3, pp. 465--482)
J.P. Françoise, G. Naber,  T.S. Tsun (eds.) Elsevier (2006)


* A. Lesne, J.M. Victor.
Chromatin fiber functional organization: some plausible models
EPJE, vol 19, 279--290, Focus Point on ''Structure and Dynamics of DNA'' (2006)


see also the commentary of this paper  by H. Schiessel, same issue (p. 291--292)

* A. Lesne.
The chromatin regulatory code: beyond an histone code
EPJE, vol. 19, 375--377, Focus Point on ''Structure and Dynamics of DNA'' (2006)


* G.G. Cabal, S. Rodriguez-Navarro, A. Genevesio, J.C.  Olivo-Marin, C. Zimmer,
O. Gadal, F. Feuerbach-Fournier, A. Lesne, H. Buc, E.C. Hurt, Ulf Nehrbass.
Molecular analysis of SAGA mediated nuclear pore gene gating activation in yeast,
 Nature, vol. 441, 770-773 (2006)
Supplementary material
voir le commentaire dans le Journal du CNRS, octobre 2006, p. 12



* J.L.Nandrino, L. Pezard, K. Doba, A. Lesne, V. Christophe.
Autobiographical memory deficit in anorexia nervosa:
emotion regulation and effect of illness duration,
 Journal of Psychosomatic Research, vol. 61, 537-543 (2006)



* A. Lesne.
Chaos in biology
Biology Forum, vol. 99, pp. 413-428 (2006)



 * C. Petit,  F. Pietri-Rouxel, A. Lesne,T. Leste-Lasserre,   D. Mathez, R.K. Naviaux,  P. Sonigo, F. Bouillaud,  J. Leibowitch.
Oxygen consumption by cultured human cells is impaired under mitochondrial DNA depletive NRTI cocktail
Mitochondrion vol. 5, 154-161 (2005)


* 
C. Gruber,  A. Lesne.
Hamiltonian model of heat conductivity and Fourier law
Physica A, vol. 351, 358-372 (2005)


*
 J.P. Aubin, A. Lesne.   (lien vers  LASTRE
Constructing and exploring wells of energy landscapes
 
J. Math. Phys. vol. 46, 1-16 (2005)


* A. Lesne.
Terms from statistical physics and dynamical systems of relevance for complex systems science
Cybergeo, No 316, July 7th 2005
European Journal of Geography, ISSN 1278--3366,  http://193.55.107.45/eurogeo2.htm
 (longer preliminary version)
 
 
 
* C. Gruber, S. Pache, A. Lesne.
On the Second  Law of thermodynamics and the piston problem
J. Stat. Phys. vol. 117, 739-772 (2004)
 
 
H. Krivine, A. Lesne.
Mathematical puzzle in the analysis of a low-pitched filter
Am. J. Phys., vol. 71, pp. 31-33 (2003)


* C. Gruber, S. Pache, A. Lesne.
Two-time-scale relaxation towards thermal equilibrium of the enigmatic  piston
J. Stat. Phys. vol. 112, 1199-1228 (2003)
 
 
* C. Gruber, S. Pache, A. Lesne.
Deterministic motion of the controversial piston in the thermodynamic limit
J. Stat. Phys., vol. 108, pp. 669-701 (2002)


* 
J.M. Victor, E. Ben-Haïm, A. Lesne
Intercalation and buckling instability of DNA linker within locked chromatin fiber
Phys. Rev. E, vol. 66, 060901 (2002)


E. Ben-Haïm, A. Lesne, J.M. Victor.
Adaptive elastic properties of chromatin fiber
Physica A, vol. 314, pp. 592-599 (2002)


E. Ben-Haïm, A. Lesne, J.M. Victor.
Chromatin: a tunable spring at work inside chromosomes
Phys. Rev. E, vol. 64, 051921 (2001)
 


P. Sotta, A. Lesne, J.M. Victor.
The coil-globule transition for a polymer chain confined in a tube: a Monte Carlo simulation
J. Chem. Phys., vol. 113, pp. 6966-6973 (2000)

 P. Sotta, A. Lesne, J.M. Victor.
Monte Carlo simulation of a grafted polymer chain confined in a tube
J. Chem. Phys. vol. 112, 1565-1573 (2000)



J.B. Imbert, A. Lesne, J.M. Victor.
On the distribution of the order parameter of the coil-globule transition
Phys. Rev.E, vol. 56, 5630-5647 (1999)


*
B. Gaveau, A. Lesne, L.S. Schulman.
Spectral signatures of hierarchical relaxation
Phys. Lett. A, vol. 258, pp. 222-228 (1999)



A. Lemarchand, A. Lesne, M. Mareschal.
Langevin approach to a chemical wave-front: selection of the propagation velocity by internal noise 
Phys. Rev. E, vol. 51, pp. 4457-4465 (1995)
 
 * A. Lemarchand, A. Lesne, A. Perera, M. Moreau, M. Mareschal.
Chemical wave front in two dimensions
Phys. Rev. E, vol. 48, pp. 1568-1571 (1993)
 
 
 
P. Collet, A. Lesne. 
Renormalization group analysis of some dynamical systems with noise
J. Stat. Phys., vol. 57, pp. 967-992 (1989)


* F. Argoul, A. Arneodo, P. Collet, A. Lesne.
Transitions to chaos in the presence of an external periodic field: cross - over effect in the measure of critical exponents,
Europhys. Lett. vol. 3, pp. 643-651 (1987)
 

Publications are under copyright, and available here only for restricted use



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CONFERENCE PROCEEDINGS


* A. Lesne, 
Modélisation multiéchelles des systèmes vivants et de leur régulation,

p. 13, Actes du colloque Commisco2010, “Modélisation Mathématique et Informatique des Systèmes Complexes”,

Bondy et Paris, 11-13  octobre 2010. 
Texte français 
English text
Proceedings full text


*A. Lesne, P. Sonigo.
L'école de Berder: une ouverture interdisciplinaire pour la biologie

Natures, Sciences et Sociétés, vol. 15, pp. 53-56 (2007)

 

* Annick Lesne, Christophe Lavelle & Arndt Benecke
Multi-scale vs function-dependent chromatin  modeling

pp. 59-70
 in Proceedings of the Bordeaux Spring School 
on “Modelling Complex Biological Systems in the Context of Genomics” , 
édité par P. Amar, F. Képès, V. Norris, M. Beurton-Aimar et J.P. Mazat,  EDP Sciences (2006).


*Journées Thématiques: Organisation, dynamique et fonction des chromosomes
(23-25 mars 2005, INSTN, CEA-Saclay), organisé par H. Buc, M.-C. Bellissent-Funel, O. Hyrien, M. Yaniv
dans le cadre du GDR 1862 du CNRS "Fonction et Dynamique des Macromolécules Biologique"
Physical modeling of diffusive movements inside the nucleus: from classical theories to open challenges pdf file


* Atelier INSERM Dynamics of intracellular processes: a dialogue between biology and physics?
Experimental methods and models
, Paris,  4-5 November 2004.
Physical aspects and modeling of intracellular transport and processes  pdf file (short)    pdf file (long)


* Colloque  3 corps,  classique/quantique et  discret/continu, École Normale Supérieure, Paris, 28-29 Septembre 2004. Programme
Modèles dynamiques continus et discrets en physique classique   pdf file
Conférence et participation aux tables rondes disponibles en ligne sur http://www.diffusion.ens.fr
     (Diffusion des savoirs à l'École  Normale Supérieure)


* Colloque  de Cerisy, Déterminismes et Complexités: du Physique à l'Éthique,  22-29 juin 2004.
Déterminisme et aléatoire dans les systèmes complexes: un faux débat?  pdf file


*
École Thematique CNRS-INRA  "Biologie intégrative: l'organisation du vivant", Berder (Morbihan), 16-22 Mars 2003
Du discret au continu (et inversement): modèles et réalité
  pdf file


* École Thématique CNRS-INRA "Forme et Information en Biologie", Berder (Morbihan), 17-23 Mars 2002
-- Lois d'échelle et approches multi-échelles en biologie 
pdf file
-- Auto-organisation en biologie 
pdf file


* Workshop on renormalization in mathematics and physics, Paris, IHP,  14-16 Juin 1996.
I   - Introduction to renormalization in statistical mechanics 
II  - Introduction to renormalization in dynamical systems.  pdf file (I+II)
III - Regularization and renormalization group    pdf file

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Main Links


IHES
Systems Epigenomics Group
LASTRE
Institut des Systèmes Complexes de Paris
http://www.editions-belin.com/belin.asp?ad=o003669
http://www.cassini.fr/
Ecole de Berder 2008 (robustesse et adaptation en biologie)
Ecole de Berder 2011 (coopérativité et singularité en biologie)

Ecole de Berder 2012 (naturel et artificiel: le vivant et ses représentations)

Mise à jour le Vendredi, 03 Février 2012 19:01